柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析

摘要：

运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒(Citrus psorosis virus,CPsV)3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组.序列分析结果表明,CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt,均包含4个开放阅读框.CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48％ ～ 95.98％,编码氨基酸相似性为98.18％ ～ 98.86％;与6个已知国外CPsV分离物的外壳蛋白基因核苷酸序列相似性为85.83％ ～ 95.23％,其对应氨基酸序列相似性为94.09％ ～ 99.32％.系统进化分析显示CHN-1、CHN-2和CHN-3与地中海沿岸国家的CPsV分离物聚为一簇,可能具有共同的起源.

关键词：柑橘、柑橘鳞皮病毒、全基因组、系统发育分析

所属期刊栏目：45

分类号：S666(果树园艺)

资助基金：国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项2017YFE0110900;重庆市科委社会事业与民生保障科技创新专项cstc2016shms-ztzx800003;重庆市基础科学与前沿技术研究专项cstc2017jcyjBX0016;国家自然科学基金项目31501611;重庆市研究生科研创新项目CYS18133

在线出版日期：2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2030-2036