桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

摘要：

从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列.对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族.PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大.聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为Clade Ⅰ、CladeⅡ和Clade Ⅲ 3类.利用荧光定量PCR (qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色.

关键词：桃、果实、成束域、阿拉伯半乳糖蛋白、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：44

分类号：S662.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31371866;浙江省自然科学基金项目LQ15C200004;浙江省重中之重学科学生创新项目1740002979

在线出版日期：2017-06-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：653-663