番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析

摘要：

以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的cDNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄LemiR390前体基因及其预测靶基因Le TAS;采用定量PCR技术检测LemiR390及其预测靶基因LeTAS3在番茄果实不同发育阶段的表达情况,利用RLM 5'RACE技术验证LemiR390对靶基因mRNA的剪切作用.结果表明,克隆到两个LemiR390的前体,分别与MIR3 90a和MIR390b一致,含有完整的茎环结构.LemiR390与其靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育时期表达量不同,果实发育前期特别是花后1～2周幼果期表达量高,发育后期均下降为微量表达,并且在幼果期LemiR390与Le TAS3表达呈负调控关系.LemiR390能够靶作用于LeTAS3的转录本调控其降解,其剪切位点为LemiR390序列5'端的第10位碱基.

关键词：番茄、LemiR390、LeTAS3、基因表达、miRNA

所属期刊栏目：42

分类号：S641.2

资助基金：东北林业大学国家基础科学人才培养基金项目201220A5;国家自然科学基金项目30800082,31272200;中央高校基本科研业务费专项资金项目DL11CA03,2572014EA03-02

在线出版日期：2015-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：271-279