通过HRM技术筛查与梨矮生性状决定位点PcDw紧密连锁的SNP标记

摘要：

在果树的基因组中存在大量的SNP(single nucleotide polymorphism)位点,筛查与目标性状紧密连锁的SNP标记,对目标基因的精细定位具有重要意义.以‘矮生梨’(Pyrus communisL.‘Aishengli’)与‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.‘Chili’)的F1杂交分离群体共215个单株为试材,参考苹果基因组的序列设计26对适合HRM分析的引物,依据分离群体分组分析(bulked segregant analysis,BSA)原理,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到两个与决定梨矮生性状的PcDw基因连锁的标记CNqau012和CNqau039,二者与目标位点的连锁距离分别是13.3 cM和2.3 cM.对CNqau012和CNqau039的扩增子测序分析表明,在矮生型与普通型中都存在一处单核苷酸变化(分别是G/A和C/T).这些标记的获得对PcDw基因的精细定位及克隆具有重要意义.

关键词：梨、矮生、性状决定位点PcDw、SNP标记、HRM

所属期刊栏目：42

分类号：S661.2(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31372049;山东省科技厅山东省良种工程——资源创新利用项目2011-2014

在线出版日期：2015-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：214-220