基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究

摘要：

从32对叶绿体DNA通用引物中筛选出8对引物用于评价辽宁省梨属种质的遗传多样性,其中4对引物所扩增的叶绿体DNA片段存在突变位点.合并后的叶绿体基因片段(3 688 bp)含有单一突变位点9个、简约信息性位点3个以及插入/缺失(INDEL)2个.在37个样品中,trnL-trnF-487区域、trnL-trnF-413区域、rbcL区域和trnS-psbC区域的单倍型分别为2个、4个、2个和3个,合并之后的叶绿体基因片段的单倍型为4个.非编码区trnL-trnF-413多态性最高,具有最高的单倍型数、最高的单倍型(基因)多样性、最高的核苷酸多样性、最高的单倍型多样性方差和最高的单倍型多样性标准差.辽宁省37份梨种质的单倍型(基因)多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)分别为0.577、0.00055.Tajima's D检验中除了rbcL区域的D值在P＜0.05水平上显著外,其余区域的D值未达显著水平,表明自然选择对rbcL区域的突变位点产生了作用.秋子梨和白梨种质共有单倍型HAP_1、HAP_2和HAP3,显示出一定的亲缘关系;西洋梨则单独共享HAP5.运用中介邻接网络(Median-Joining network,MJ)算法绘制的中介网络图显示HAP1与HAP2、HAP_3的亲缘关系较远,而HAP5则与上述3个单倍型的亲缘关系较远.

关键词：梨、叶绿体DNA、单倍型、遗传多样性

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分类号：S661.2(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31272128;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项2011006

在线出版日期：2014-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1307-1316