基于EST信息的百合SSR标记的建立

摘要：

依据已知的百合EST(expressed sequence tags)序列信息,开发新的SSR(simple sequence repeats)标记,在NCBI的EST数据库1 688条EST中检索到98条含有101个SSR的序列, SSR的检出率为5.98%,其中三核苷酸重复类型占主导地位,出现频率为2.84%.EST-SSR的重复基元共搜索到47种,其中三核苷酸重复基元类型最为丰富,大约占重复基元类型总数的一半.利用部分EST-SSRs序列共设计23对SSR引物,以铁炮百合'Snow Queen' DNA为模板,对引物进行筛选,其中18对引物有扩增产物,占所设计引物总数的78.26%;进一步用这些引物在5个杂种系列13个百合品种进行多态性测试,显示多态性的引物占可扩增引物的66.7%.本研究结果证明了基于百合EST信息建立SSR标记是一种有效而又可行的方法.

关键词：百合、EST、SSR、引物设计

所属期刊栏目：35

分类号：S682.2(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家社会公益研究专项基金2005DIB3J022;国家高技术研究发展计划863计划2006AA100109;国家科技支撑计划2006BAD01A18;北京市花卉重点项目YLHH2006001;YLHH2006002

在线出版日期：2008-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1069-1074