基于生物信息学分析UBE2C、TTK和CP对卵巢癌预后的影响
目的 基于生物信息学分析筛选与卵巢癌预后不良相关的重要基因.方法 从基因表达汇编数据库获得表达谱,鉴定出|logFC|>1.5和P<0.05的差异表达基因(DEG),进行功能富集、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建、功能模块分析、生存分析和相关性分析.结果 首先,确定135个表达一致的基因,33个上调DEG主要富集在有丝分裂纺锤体组装检查点、染色体分离调控等;102下调DEG主要富集在神经递质水平的调节、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调控等.然后构建PPI网络,筛选20个hub基因并进行生存分析和表达相关性分析,同时筛选符合要求的模块并分别对基因进行途径富集分析.最后,取交集得到UBE2C、TTK、CP在卵巢癌中高表达并且导致预后不良.结论 通过基于数据库的生物信息学综合分析,筛选出影响卵巢癌患者预后的3个关键候选基因,这些基因可为治疗提供新思路.
转录组分析;差异表达基因;卵巢癌;预后
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R737.3(肿瘤学)
山西省自然科学基金面上项目201701D121156
2022-03-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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