肝细胞内质网应激对tsRNA表达谱的影响及其功能研究

摘要：

目的 探讨肝细胞内质网应激相关的tRNA衍生性小RNA(tRNA derived small RNA,tsRNA)表达谱及其功能特征.方法 将AML12细胞随机分为对照组和高脂组,采用棕榈酸刺激高脂组,建立肝细胞内质网应激模型.以RT-qPCR和Western blot法检测内质网应激标志蛋白GRP78和CHOP的表达,油红O染色法观察脂滴生成情况.通过高通量测序技术检测tsRNA表达谱并筛选出差异基因.利用生物信息学分析预测差异tsRNA的靶基因,并通过GO分析和KEGG分析研究差异tsR-NA的潜在功能.结果 与对照组比较,棕榈酸干预导致高脂组GRP78和CHOP表达在mRNA及蛋白水平均显著升高(P<0.05),脂肪变性显著加重.tsRNA测序得到38条差异tsRNA(倍数变化>2,P<0.05).GO分析显示,差异tsRNA的靶基因主要调控类黄酮代谢、葡萄糖醛酸代谢和岩藻糖基化等功能.KEGG分析显示,差异tsRNA的靶基因在戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、淀粉和蔗糖代谢、cAMP及Rap1等肝细胞代谢相关的信号通路中高度富集.结论 内质网应激可显著改变肝细胞的tsRNA表达谱,其功能可能与调控肝脏糖代谢及生物转化作用有关.

关键词：tsRNA、内质网应激、肝细胞、生物信息学

所属期刊栏目：50

分类号：R575.5(消化系及腹部疾病)

资助基金：国家重点研发计划项目精准医学研究专项基金资助项目;国家自然科学基金资助项目

在线出版日期：2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：27-32