10.3969/j.issn.1006-1959.2023.14.001
基于生物信息学方法探究SERINC2基因在宫颈癌中的表达及其作用机制
目的 通过生物信息学方法分析SERINC2在宫颈癌中的表达及其功能特性.方法 利用基因表达谱数据动态分析(GEPIA)探究SERINC2基因在宫颈癌及癌旁组织的表达,评价其与宫颈癌患者的生存预后关系;并在人蛋白质数据库(HPA)中获取SERINC2蛋白在宫颈癌和癌旁组织的表达情况;基于Ualcan数据库分析SERINC2甲基化水平与宫颈癌临床病理特征之间的相关性;利用Linked Omics数据库探索SERINC2的共表达基因,并进一步分析SERINC2基因在宫颈癌发展过程中可能参与的信号调控通路.结果 宫颈癌组织中SERINC2基因表达高于癌旁组织(P<0.05),且与患者不良预后相关.宫颈癌组织中的SERINC2甲基化水平低于癌旁组织(P<0.05).共表达结果分析显示,GALE、GPRC5A、TINAGL1、C9orf167和CAP1等基因与SERINC2表达呈正相关,SCML2、KDM2B、GLS2、ARHGAP19和SCAL等基因与其表达呈负相关(FDR<0.05);SERINC2基因参与了半乳糖代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢、聚糖的合成和降解等一系列与糖代谢相关的过程(P<0.05,FDR<0.25).结论 SERINC2基因在宫颈癌中高表达,与宫颈癌的发生发展及不良预后有关,SERINC2基因可能成为宫颈癌预后评估和治疗的靶点.
宫颈癌、SERINC2、甲基化、糖代谢、生物信息学分析
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R737.33(肿瘤学)
云南省科技厅科技计划项目202101AU070136
2023-08-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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