影响前列腺癌风险的关键基因识别

摘要：

目的 基于TCGA数据库筛选影响前列腺癌(PCa)风险水平的关键基因,并建立PCa患者生存风险预测模型.方法 从TCGA数据库下载PCa患者基因表达数据及相关临床数据,通过前期研究初步筛选基因,并将患者分为高、低风险两类;对基因进行差异表达分析和GO和KEGG通路富集分析,筛选相关基因和信号通路;对差异表达基因进行蛋白互作网络分析,标记出关键基因;将关键基因的表达数据与PCa患者生存时间纳入Cox回归分析,建立生存风险预测模型.结果 前期研究得到620个基因,高风险患者234例,低风险患者285例;差异表达分析获得30个基因,主要分子功能(MF)为:受体结合和生长因子活动,生物学过程(BP)主要为细胞-细胞信号传导、细胞增殖的积极调节、血管生成的调节和细胞表面受体信号通路,细胞组分(CC)主要定位于细胞外区域,而KEGG信号通路为细胞因子-细胞因子受体相互作用;蛋白互作分析中共7个基因有相互作用,Cytoscape筛选出5个关键基因:PHYHIPL、CNTFR、GFRA1、EDN3和PROK1.结论 通过本研究识别的影响PCa预后的关键基因,发现潜在的PCa风险靶点,可能为PCa的治疗和预后提供帮助.

关键词：前列腺癌、基因差异表达分析、生物信息学、富集分析

所属期刊栏目：33

分类号：R737.25(肿瘤学)

在线出版日期：2020-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：80-85