圈养梅花鹿肠道菌群组成的性别差异

摘要：

为探究圈养梅花鹿(Cervus nippon)肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异,利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增,采用生物信息学手段以性别作为分组因素,分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种.结果显示:在门水平上,圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes;雄性61.69%,雌性58.23%)和拟杆菌门(Bacteroidetes;雄性27.40%,雌性31.19%);在属水平上,优势菌属为拟杆菌属(Bacteroides;雄性4.60%,雌性6.13%)和梭菌属(Clostridium_IV;雄性3.42%,雌性3.25%).雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的α多样性无显著差异(p>0.05).β多样性分析表明,不同性别梅花鹿的肠道菌群组成相似度较高,且组间不存在显著差异(p>0.05).STAMP和LEfSe分析表明,雌性圈养梅花鹿中起重要作用的菌群为拟杆菌门(LDA值>4,p<0.05).研究表明,圈养梅花鹿肠道菌群结构及多样性性别间无显著差异,但雄、雌梅花鹿肠道中个别菌门、菌属的分布存在一定差异,拟杆菌门受宿主性别影响较大.

关键词：肠道菌群、梅花鹿、圈养、性别

所属期刊栏目：44

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;东北林业大学大学生创新训练项目

在线出版日期：2023-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：330-338