基于高通量测序技术对不同季节圈养褐马鸡肠道菌群多样性分析

摘要：

为提高褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum)疾病防控能力和饲养管理水平,利用高通量测序技术对其肠道菌群进行多样性分析,探知其肠道菌群在不同季节的变化规律,并预测潜在致病的高发时间段,结果表明:门水平上,圈养褐马鸡的肠道优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes,52.11％)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.20％)、变形菌门(Proteobacte-ria,17.91％)和放线菌门(Actinobacteria,7.32％);属水平上,Rikenellaceae_RC9_gut_group为优势菌属(5.56％),其次是链球菌属(Streptococcus,5.47％)和脱硫弧菌属(Des-ulfovibrio,4.74％).通过组间差异分析结合不同季节菌群变化规律,以春、夏、秋、冬四季依次排序,厚壁菌门呈递减趋势;拟杆菌门在春季组和夏季组较低,在秋季组和冬季组呈递增趋势,冬季组丰度为36.72％;变形菌门在夏季组丰度最高(34.81％),差异显著(P<0.05);Rikenellaceae_RC9_gut_group最为优势,春季组至夏季组呈递减趋势,秋、冬组逐渐升高,冬季组达到峰值,差异显著(P<0.05);链球菌属在夏季呈爆发式增长(21.84％),其他各组均低于0.05％,同时,潜在致病性预测也发现夏季组患病风险明显增加.综上,不同季节圈养褐马鸡的肠道菌群会发生相应的改变,夏季则是褐马鸡消化道疾病高发季节.

关键词：褐马鸡、肠道菌群、季节变化

所属期刊栏目：43

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：北京动物园圈养野生动物技术北京市重点实验室开放课题ZDK202003

在线出版日期：2022-11-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：990-998