基于高通量测序技术的美洲獾肠道微生物多样性分析

摘要：

采用高通量测序技术对5只美洲獾的新鲜粪便进行测序,并进行生物信息学分析.结果表明:(1)测序获得高质量的140922条原始序列,平均序列为(27964±757)条,并归类于80个OTUs;(2)所有样品共含有10个菌门,74个菌属.其中,核心菌门5个,分别是厚壁菌门(73.01％)、拟杆菌门(9.31％)、变形菌门(7.44％)、放线菌门(3.08％)和疣微菌门(1.66％);核心菌属21个,占样品微生物总量的47.45％,此外,未分类的菌属占微生物总量的39.18％.由此可见,美洲獾肠道微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定,为进一步研究美洲獾肠道菌群结构与功能提供了参考依据.

关键词：美洲獾、肠道微生物、高通量测序、16S rRNA

所属期刊栏目：39

分类号：S852.6(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：938-942