东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

PDK1是PI3K/Akt信号通路中的一个重要的激酶.在哺乳动物中,P13 K/Akt信号通路是一条保守的通路,通过激活下游的因子对糖代谢、脂肪代谢以及蛋白质代谢,细胞的增殖、分化、凋亡等起调节控制作用.本研究基于东北林蛙转录组数据,从中鉴定出PDK1基因3条Unigene序列,并通过RACE法克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为rdPDK1,其全长为1 990 bp,开放阅读框长1 674 bp,编码557个氨基酸.进行生物信息学分析,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量63.7 kD,等电点为7.21.该蛋白第82 ～ 344个和443 ～ 549个氨基酸是2段保守结构域STKc激酶域和PH调节结构域.同源性分析表明rdPDK1蛋白与HsPDK1蛋白氨基酸序列一致率为79％,相似率为100％;与MmPDK1蛋白氨基酸序列一致率为80％,相似率为100％.本研究结果有望为进一步研究东北林蛙PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础.

关键词：东北林蛙、PDK1基因、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：38

分类号：Q959.5(动物学)

资助基金：国家自然科学基金项目31672309

在线出版日期：2017-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：641-647