虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究

摘要：

对虎皮鹦鹉(Melopsittacus undulatus)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到1～6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1Gb)的0.41％,分布频率为82.9/Mb.不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7％;其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3％,13.7％,10.8％,2.9％,0.5％.单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAAGA最多,六碱基中AACCCT最多.A、AT、C、AC、AAT、AAAC、AAAT、AGG、AGC、AG、AAAG、AAC、ATCC、AAGG、AGAT、ATC、AACC、ACC依次是虎皮鹦鹉基因组中分布数量最多的18种微卫星重复拷贝类型.本研究将为虎皮鹦鹉微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础.

关键词：虎皮鹦鹉、基因组、微卫星

所属期刊栏目：38

分类号：Q78;Q953(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目31501845;商丘师范学院高层次人才科研启动项目50013901,50014001

在线出版日期：2017-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：422-426