无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析

摘要：

经PCR扩增和序列测定,获得了无蹼壁虎(Gekko swinhonis)的线粒体基因组全序列,其总长为16 818 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区.各基因的位置、排列顺序及转录方向均和大部分的有鳞目物种一致.无蹼壁虎线粒体基因组的碱基组成分别为:A(31.35％)、T(26.28％)、C(27.71％)、G(14.67％).除Ser(GCU)缺失DHU臂外,其余的21个tRNA都可以形成典型三叶草结构.13个蛋白质编码基因中,除ND2基因以ATA为起始密码子外,其余12个基因均使用ATG为起始密码子.无蹼壁虎5个基因(ND1、ATP8、ATP6、ND4L、ND4)以TAA为终止密码子,ND6和Cytb基因以TAG为终止密码子,CO1以AGA为终止密码,其余5个基因为不完全终止密码TA-或T-(ND2、CO2、ND5和CO3为T-,ND3为TA-).控制区位于tRNAPro和tRNAPhe之间,全长1 456 bp,含有一些终止相关序列和保守序列(TAS,CBS1-3).基于13个蛋白质编码基因氨基酸序列构建的BI系统发育树分析表明,无蹼壁虎与壁虎科的Tarentola mauritanica的亲缘关系最近.

关键词：无墣壁虎、线粒体基因组、系统发育

所属期刊栏目：38

分类号：Q951+.3;Q78(动物学)

资助基金：广西珍稀濒危动物生态学重点实验室项目1501z003

在线出版日期：2017-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：94-102