药用石斛及其混伪品的DNA条形码分子鉴定

摘要：

[目的]筛选合适的DNA条形码序列并建立高效准确鉴定药用石斛(Dendrobium)的方法.[方法]以12种药用石斛的82个样品为材料,提取样品总DNA,对核基因片段ITS和ITS2、叶绿体基因片段psbA-tmH和matK序列进行扩增和测序;利用生物信息学软件进行序列特征、DNA条形码序列间隔(barcoding gap)和系统发育分析.[结果]4条序列扩增成功率均为100％,其中ITS和ITS2测序成功率最高,均为97.6％,其次是matK为96.3％,psbA-tmH为95.1％;ITS和ITS2序列与其他序列相比,种内和种间存在重叠的部分较少,具有条形码序列间隔.系统发育树表明:ITS和ITS2序列能够成功区分12种药用石斛及混伪品,psbA-trnH序列未能把叠鞘石斛(D.aurantiacum Rchb.f.var.denneanum)、双斑叠鞘石斛(D.aurantiacum Rchb.f.var.zhaojuense)和流苏石斛(D.fimbriatum)以及混伪品全部区分开,matK序列未能把叠鞘石斛和流苏石斛区分开;4条序列联合构建的系统发育树与ITS和ITS2单序列构建的系统发育树相似.[结论]以ITS和ITS2序列为主,psbA-trnH和matK序列为辅的DNA条形码鉴定方法能够对药用石斛及其混伪品进行快速准确的鉴定.

关键词：药用石斛;DNA条形码;系统发育分析;分子鉴定

所属期刊栏目：36

分类号：S682.310.1(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：云南省重大科技专项;国家重点研发计划;云南省教育厅科学研究基金项目

在线出版日期：2022-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：862-871