鸡白痢沙门氏菌感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响

摘要：

[目的]鉴定感染鸡白痢沙门氏菌后雏鸡脾脏差异表达的miRNA,为阐明miRNA在鸡白痢沙门氏菌感染中的调控机制提供理论基础.[方法]采集感染和未感染鸡白痢沙门氏菌的SPF雏鸡脾脏,提取脾脏RNA,构建 6个miRNA文库;利用Illumina Hiseq 2500测序技术和生物信息学分析筛选差异表达miRNA,通过TargetScan和miRanda算法预测差异表达miRNA的靶基因,并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后利用RT-qPCR方法验证测序结果.[结果]鉴定到 29个差异表达miRNAs,其中 15个显著上调、14个显著下调.GO分析表明:脂多糖介导的信号通路正调控以及NIK/NF-κB介导的信号通路负调控等免疫相关生物学过程显著富集;KEGG分析显示:差异表达的miRNA主要参与溶酶体和内吞作用等免疫相关通路.高通量测序结果与RT-qPCR结果一致.[结论]成功鉴定到鸡白痢沙门氏菌感染雏鸡脾脏miRNA表达谱,获得29个鸡白痢沙门氏菌感染潜在相关miRNAs.

关键词：鸡白痢沙门氏菌、SPF雏鸡、脾脏、差异表达miRNA、免疫

所属期刊栏目：38

分类号：S858.312.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：云南省万人计划;国家蛋鸡产业技术体系项目

在线出版日期：2023-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：220-227