基于TCGA数据库和GEO数据库分析SERPINE1在胃癌中的表达和预后影响

摘要：

目的 分析SERPINE1 在胃癌组织中的表达及其临床意义.方法 通过检索肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,了解SERPINE1 在33 种癌症组织中的表达情况.通过检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载375 例胃癌组织和32 例癌旁组织的RNA-Sep数据和临床信息,通过检索基因综合表达(GEO)数据库GSE54129 数据集下载了111 例胃癌组织和21 例癌旁组织的基因表达谱芯片,分别将TCGA和GSE54129 数据集中的SERPINE1 进行癌组织和癌旁组织的表达差异分析,COX分析TCGA数据集中临床基线资料和SERPINE1 mRNA表达水平对胃癌患者预后的影响.绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线(ROC)分析SERPINE1 mRNA表达与预后的关系.通过基因富集分析(GSEA)挖掘并预测SERPINE1 参与的通路.结果 TIMER数据库分析表明,SERPINE1 在 8种癌组织中明显高表达(P＜0.05).TCGA数据集、GSE54129 数据集分析表明,在胃癌组织中SERPINE1 表达高于癌旁组织(P＜0.001).多因素COX分析表明,病理Stage4、SERPINE1 mRNA表达水平高是影响胃癌患者预后生存时间的独立危险因素[HR(95％CI)=3.061(1.107～8.464)、1.778(1.224～2.582),P＜0.05)].Kaplan-Meier生存曲线分析发现,SERPINE1 高表达组总生存期明显低于低表达组(P＜0.001).ROC曲线分析发现,SERPINE1 表达预测1、3、5 年生存几率的曲线下面积分别为0.598、0.649、0.731.GESA分析说明SERPINE1 与上皮间质转化、炎性反应、细胞顶端连接复合物、KRAS通路、血管生成等通路存在相关性.结论 SERPINE1 在胃癌组织中表达明显上调,其高表达预示胃癌患者预后不佳,SERPINE1 可作为影响胃癌患者预后的一种生物学标志物,并作为潜在的治疗靶点.

关键词：胃癌、SERPINE1、癌症基因组图谱数据库、基因表达数据库、预后

所属期刊栏目：22

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：政府资助临床医学优秀人才培养项目

在线出版日期：2023-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：49-53,66