基于SNP标记的糯玉米种质资源遗传多样性分析

摘要：

为了提高糯玉米种质资源的利用效率,挖掘优异糯玉米种质资源、改良糯玉米品种,利用(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片技术对44份不同来源的糯玉米自交系和5份分别代表中国玉米5大类群的普通玉米自交系进行全基因组扫描.结果 表明,34257个SNP标记在49份玉米自交系中的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.02～0.56,平均含量为0.32;最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)≥0.03.49份玉米自交系间的状态一致性(identity-by-state,IBS)变幅为0.59～0.99,平均为0.68.基于IBS利用Neighbor-joining(NJ)聚类分析方法,将49份自交系划分为5个类群,分别包含19份、9份、4份、9份和3份材料,其中系谱来源不清晰的糯玉米自交系被划分至不同类群,明确了它们的亲缘关系.

关键词：糯玉米、SNP标记、遗传多样性

所属期刊栏目：28

分类号：S513.024(禾谷类作物)

资助基金：上海市种业发展项目;上海市科委科研计划;上海市科委科研计划;上海市科委科研计划;上海市农业科学院卓越团队项目;上海市市级农口系统青年人才成长计划;上海市市级农口系统青年人才成长计划;上海市农业科学院青年科技人员助跑计划

在线出版日期：2020-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：44-51