玉米△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因家族生物信息学分析

摘要：

△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase,P5CS)是脯氨酸代谢途径的关键酶,对植物抵抗逆境胁迫起至关重要的作用.为了探索P5CS在玉米对逆境胁迫的响应,本文对5个玉米P5CS基因家族蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、基因结构、进化关系及保守基序等方面进行初步生物信息分析.结果显示,5个玉米P5CS蛋白中有3个偏酸性,1个显中性,1个偏碱性;2个以无规则卷曲为主要构成元件,3个P5CS蛋白主要以α白螺旋为主要构成元件;不稳定指数分析发现,4个P5CS蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的P5CS蛋白为亲水性蛋白;玉米P5CS家族内含子最少含有4个内含子,最多的含有19个内含子;亚细胞定位分析表明,P5CS均蛋白定位于细胞基质;进化分析表明,PSCS家族分3个亚家族.

关键词：玉米、1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)、生物信息、基因家族

所属期刊栏目：24

分类号：S513.035.3(禾谷类作物)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务专项1630062014010,1630062015017,1630062015003、海南省自然科学基金20153134

在线出版日期：2016-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：40-46