基于高通量测序的烟草粉螟基因组初步研究

摘要：

为研究烟草粉螟基因组信息,基于低深度高通量测序,利用Illumina测序平台对烟草粉螟基因组进行了分析,采用K-mer法预测烟草粉螟基因组大小、杂合度和重复序列等基因组特征,并使用SOAP de novo软件对烟草粉螟基因组进行了初步组装.研究表明:①烟草粉螟预估基因组大小为546.4 Mb,杂合度为1.93％,重复序列比例为48.59％,GC含量为36.9％,属于复杂昆虫基因组.②基因组初步组装后,得到3192823条Contigs,Contig N50为244 bp,组装质量较低.对烟草粉螟基因组的初步研究为后续获得高质量烟草粉螟全基因组信息提供了必要参考.

关键词：烟草粉螟、基因组调查、K-mer分析、基因组大小、杂合度

所属期刊栏目：54

分类号：S435.72(病虫害及其防治)

资助基金：郑州烟草研究院青年人才托举工程项目122020CR0240

在线出版日期：2021-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：8-13