宏转录组测序揭示褐土脲酶基因的表达丰度和细菌来源

摘要：

为明确褐土中脲酶编码基因的表达丰度,通过土壤RNA提取和宏转录组测序法,筛选RNA水平上表达较高的脲酶基因,共筛选到122个脲酶结构基因(93个ureC、16个ureB和13个ureA)和脲酶辅助基因115个(29个ureD、12个ureE、36个ureF、29个ureG、5个ureH和4个ureJ).其中ureB、ureA、ureG、ureH和ureJ所有转录本TPM值都小于2,而ureC、ureD、ureE和ureF丰度最高的转录本TPM值分别为3.17、5.37、2.01和2.71.细菌来源的芽孢杆菌属Bacillus、芽孢八叠球菌属Sporosarcina、节杆菌属Arthrobacter、链霉属Streptomyces和类芽孢杆菌属Paenibacillus等在褐土脲酶活性的发挥中贡献度较大.

关键词：褐土、宏转录组测序、脲酶结构基因、脲酶辅助基因、细菌

所属期刊栏目：53

分类号：TS414(烟草工业)

资助基金：河南省自然科学基金资助项目"基于宏基因组和宏转录组学研究褐土脲酶群落构成与抑制效应分析";河南省自然科学基金资助项目"小麦-土壤系统中邻苯二甲酸酯的污染特征及植株响应分子机制研究";国家自然科学基金资助-青年科学基金项目"青枯病菌对氟啶胺的抗性机制研究"

在线出版日期：2020-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：7-14