基于高通量测序的烟草甲基因组调查分析

摘要：

为更好破译烟草甲全基因组信息,基于Illumina高通量测序平台对烟草甲基因组进行了调查分析.预测了其基因组大小,同时分析了基因组的杂合度、重复序列、GC含量等基因组基本特征,并在此基础上对烟草甲基因组进行了初步组装.研究表明:①烟草甲预估基因组大小为242.25 Mb,杂合率为0.77％,重复序列比率为42.95％,GC含量为44.61％.②基因组组装后,得到418693条scaffolds,拼接序列总长为211.10 Mb,N50为1864 bp.通过基因组调查分析为后续的烟草甲全基因组测序提供了重要的理论依据.

关键词：烟草甲、基因组调查、基因组大小、杂合率、GC含量

所属期刊栏目：53

分类号：S435.72(病虫害及其防治)

资助基金：郑州烟草研究院院长科技发展基金项目"烟草甲RNAi生物防治的靶基因筛选和鉴定"902018CA0270

在线出版日期：2020-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6