烟草非特异性脂质转移蛋白基因的克隆与表达分析

摘要：

为了阐明非特异性脂质转移蛋白基因NtLTP1.1在烟草抗病抗逆反应中的功能，用cDNA末端快速扩增技术（Rapid-amplification of cDNA ends，RACE）从普通烟草中克隆了该基因全长，并通过生物信息学方法分析了cDNA序列结构、蛋白理化性质、保守基序、三级结构以及系统进化关系；利用qRT-PCR检测了该基因在不同组织中的表达模式以及胁迫条件下的表达差异。结果表明：NtLTP1.1基因全长615 bp，编码蛋白含有129个氨基酸，为一种小分子碱性可溶性蛋白。蛋白序列N端含有信号肽，预测其可能定位于分泌途径中。Blast比对结果显示，烟草非特异性脂质转移蛋白与番茄nsLTP1序列相似性最高，含有8CM保守基序（8个半胱氨酸残基组成的保守基序）。蛋白三级结构预测表明，NtLTP1.1具有nsLTP典型的三级结构，包括4个α-螺旋，4对二硫键，1个可结合和容纳脂质分子的疏水腔。多重比对结果显示， NtLTP1.18CM结构域模式为C1-X9-C2-X13-C3C4-X19-C5XC6-X22-C7-X13-C8。系统进化分析结果表明，nsLTP进化形成5类，NtLTP1.1属于Type I。表达模式分析显示，NtLTP1.1基因主要在烟草叶片中表达，具有明显的组织表达特异性。在低温胁迫条件下表达受到抑制，在水杨酸诱导条件下表达上调。因此，推测NtLTP1.1基因可能在烟草防御反应中发挥作用。

关键词：烟草、非特异性脂质转移蛋白基因、克隆、表达分析、生物信息学

分类号：TS413(烟草工业)

资助基金：国家烟草专卖局烟草基因组计划重大专项项目“烟草全基因组表达图谱构建和分析”902012AA0300。

在线出版日期：2015-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：12-20