烟草黄瓜花叶病毒湖北分离物全基因组序列分析及亚组鉴定

摘要：

为明确我国湖北烟区烟草黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亚组类型,对湖北地区侵染烟草的CMV HB24株系进行基因组全长克隆和序列分析 结果表明,HB24株系RNA1(GenBank序列号:KC019299)全长为3363个核苷酸(nt),编码993个氨基酸的1a蛋白;RNA2(GenBank序列号:KC019300)全长为3049nt,编码859个氨基酸的2a蛋白和111个氨基酸的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:KC019301)全长为2216nt,编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP蛋白 核苷酸序列同源性分析表明,HB24与Fnv,SD和Q株系RNA1同源性分别为91.6％,91.1％和75.9％,RNA2同源性分别为91.8％,97.8％和69.5％,RNA3同源性分别为92.1％,93.4％和73.2％;与同属花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株系RNA1,RNA2和RNA3的同源性分别为65.5％,56.7％和54.1％,与同属番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株系同源性分别为66.9％,57.7％和51.5％ HB24 RNA3 5'NTR(Nontranslated region)的结构分析以及RNA35'NTR和CP基因核苷酸序列系统进化树的分析表明,HB24属于CMV亚组IB.

关键词：黄瓜花叶病毒、基因组、同源性、系统进化树

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：国家烟草专卖局科技项目和郑州烟草研究院科技项目“烟草主要病毒病分子变异监控及追踪技术研究”122009CZ0410

在线出版日期：2014-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：80-84