烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

为了获得烟草OR(NtOR)基因的全长序列和进一步揭示其在特色烟叶形成中的作用,采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了NtOR的全长cDNA和基因组DNA序列,GenBank登录号为JN379458和JN375578.生物信息学分析表明,NtOR基因组DNA全长5027bp,cDNA为1188 bp,编码317个氨基酸残基.NtOR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点,二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠,亚细胞定位于质膜上.系统进化与BLAST分析表明,NtOR是SlOR和ViOR的垂直同源基因.GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示,NtOR基因在子叶中的表达量最高,其次是成熟叶片、幼茎和花,其他组织器官的表达相对较弱.

关键词：烟草、橙蛋白基因、克隆、生物信息学

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：贵州省科学技术基金项目黔科合J字[2010]2088号;贵州省烟草专卖局公司项目黔烟科2010-02“贵州省不同风格特色烟叶形成的分子机制研究”;贵州省烟草专卖局公司项目“烟草类胡萝卜素致香前体物质合成途径关键酶基因克隆及表达研究”黔烟科2010-12

在线出版日期：2012-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：60-66