10.16068/j.1000-1824.2022.01.009
基于网络药理学探讨松花粉抗疟原虫的机制
[目的]应用网络药理学结合生物信息学方法探讨松花粉抗疟原虫的可能机制.[方法]通过检索TCMSP数据库筛选出松花粉活性成分及其相关靶点,并查阅文献进行补充,得到候选有效成分.通过Uniprot数据库将靶点名称转换成基因名称,在GeneCards数据库中寻找疟原虫相关靶点,选择松花粉作用靶点与疟原虫相关靶点的交集筛选出松花粉抗疟原虫的活性成分及作用靶点.利用Cytoscape 3.8.0软件构建松花粉活性成分-作用靶点网络,筛选出关键化合物,通过STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,筛选出关键靶点.采用DAVID在线分析平台对靶点基因进行GO富集分析和KEGG代谢通路分析,明确生物学机制.最后利用AutoDockTools 1.5.6和AutoDockVina软件对与抗疟原虫的相关核心靶点进行分子对接.[结果]从松花粉中筛选出10个有效成分及120个作用靶点,其中与疟原虫相关的作用靶点42个,关键靶点6个.功能分析结果显示,交集基因主要集中在氧化还原过程中.与松花粉抗疟原虫有关系的作用通路可能涉及药物代谢-细胞色素P450、细胞色素P450对异生物的代谢、NF-κB信号通路、细胞黏附分子、代谢途径等.分子对接结果显示,核心靶点与山奈酚、谷甾醇、柚皮素、花旗松素和氯化花青素有较强的亲和力.[结论]网络药理学及生物信息学方法对研究松花粉及其类似物的基因靶点、揭示潜在抗疟原虫生物学活性机制、研究疟原虫有关疾病的治疗机制具有重要意义.
松花粉、网络药理学、疟原虫
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R285(中药学)
吉林省科技发展计划项目;吉林省大学生创新训练计划项目;延边大学校级科研项目
2022-07-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
35-40