泡桐NLR基因家族分析及其对植原体的响应

摘要：

为研究PfNLR基因家族在白花泡桐抗丛枝病过程中的作用,运用生物信息学方法全面分析了白花泡桐NLR(PfNLR)家族成员的组成、理化性质、染色体定位、进化、结构、顺式作用元件和组织表达特异性,结合植原体侵染白花泡桐前后的miRNA和转录组的表达量变化,筛选出与抗丛枝病相关的基因.结果表明:白花泡桐中的199个PfNLRs分属6个亚家族;91.9％的PfNLRs定位在白花泡桐18条染色体上,其中62.8％呈簇状分布,23个PfNLRs发生了 10次染色体片段重复事件和1次染色体串联重复事件;PfNLR含激素类和胁迫类元件;miRNA和转录组的关联分析发现泡桐miRNA 与PfNLR之间存在156对靶向关系;大多数 PfNLRs在芽和根中表达;16个PfNLRs在白花泡桐感染植原体前后的表达水平显著差异.进一步分析发现,pf-miRNA482介导的PfNLR181在白花泡桐抗丛枝病中发挥作用,该结果可为解析白花泡桐NLR蛋白的功能提供理论依据.

关键词：白花泡桐、NLR家族、植原体、miRNA、转录组

所属期刊栏目：44

分类号：S763(森林保护学)

资助基金：中原学者科学家工作室建设专项

在线出版日期：2024-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：7-20