NDM-1型金属β-内酰胺酶的生物信息学分析

摘要：

目的 了解新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)的氨基酸组成、理化性质、二三级结构和系统进化等,为进一步研究其作用机制和生物学功能奠定基础.方法 利用Compute pI/MW、ProtParam、SOPMA等生物信息学方法,对NDM-1进行分析.结果 NDM-1的等电点为5.07,疏水性GRAVY值为0.107;二级结构存在螺旋、折叠和转角等,没有信号肽和跨膜区域;三级结构由3个α-螺旋和4个β-折叠片组成;属于Family Lactamase_B (PF00753)蛋白质家族;其基因序列与海洋细菌(Erythrobacter litoralis) HTCC2594的β-内酰胺酶Ⅱ基因同源性最近.结论 NDM-1可能起源于环境,通过基因水平转移被传递给临床致病菌,并在抗生素的选择压力下,成为威胁人类健康的全球性问题.

关键词：新德里金属β-内酰胺酶1、生物信息学、同源序列、结构预测

所属期刊栏目：22

分类号：Q556(酶)

资助基金：成都医学院创新性实验项目:多重PCR技术检测府南河肠杆菌科四环素耐药基因CX2010023

在线出版日期：2012-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1161-1163