基于基因表达谱数据筛选膀胱尿路上皮癌潜在的治疗药物

摘要：

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)及药物基因组学(CMap)数据库筛选膀胱尿路上皮癌(BLCA)潜在的治疗药物,为BLCA的药物治疗提供新的思路.方法 提取TCGA数据库中BLCA患者和BLCA转录组的临床数据,通过 WGCNA分析,选择与BLCA肿瘤分期、分级、生存状态、生存时间等临床特征相关的基因模块,并联合CMap数据库筛选BLCA患者候选的治疗药物.结果 BLCA癌组织与正常膀胱组织中差异表达的RNA有3 729种,通过 WGCNA分析,BLCA转录组数据聚类为9个共表达的基因模块,选择与BLCA肿瘤分期、分级、生存状态等临床性状相关的基因模块,联合CMap数据库筛选出11种与该基因模块表达负相关的小分子药物.结论 通过对TCGA数据库联合CMap数据库筛选出11种小分子药物进行分析,结果 表明这些小分子药物可能对BLCA有潜在的治疗价值.

关键词：膀胱尿路上皮癌、TCGA数据库、CMap数据库、药物治疗

所属期刊栏目：15

分类号：TP311.13;R737.9;TP181

资助基金：阜阳市自筹经费科技计划项目FK202081018

在线出版日期：2023-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：203-207