10.3870/j.issn.1674-4624.2021.01.009
CDR1as在前列腺癌中表达及作用机制探索
目的 探索CDR1as在前列腺癌中的作用及机制.方法 选取34例前列腺癌患者术后标本的癌及癌旁配对组织样本进行高通量测序筛选出的差异表达circRNA-CDR1 as作为研究对象,另选取17例前列腺癌患者术后标本的癌及癌旁配对组织样本和3种前列腺癌相关细胞系进行RT-qPCR验证CDR1 as表达量,利用3种CDR1 as的siRNA干扰处理PC3细胞并进行高通量测序,选取与组织测序结果中差异表达mRNA变化趋势一致的mRNA作为被CDR1 as调控的下游靶基因,采用Pearson相关性分析组织测序结果中与CDR1 as表达变化存在相关性的基因,利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的临床数据信息,分析差异表达的基因对前列腺癌预后的影响,采用miRanda软件预测CDR1as与miRNA的结合位点,通过circinteractome网站预测CDR1as是否与蛋白质存在结合位点,利用ORF Finder网站及IRES网站对CDR1 as是否具有翻译蛋白质潜能进行分析.结果 CDR1as在癌组织中的表达量低于癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05).相比于前列腺正常上皮细胞系RWPE1,CDR1 as在前列腺癌细胞系PC3中高表达,在LNCap中低表达(P<0.05);共筛选出7个显著上调的mRNA和37个显著下调的mRNA作为在前列腺癌发生、发展中被CDR1 as调控的下游靶基因;共有19个基因在前列腺癌患者肿瘤组织中与CDR1 as表达变化存在相关性,其中12个基因在癌与癌旁组织中表达差异变化与CDR1 as表达差异变化存在相关性,低表达的GSTM5与前列腺癌不良预后有关;经相关数据库预测,CDR1as与68个miRNA存在结合位点,CDR1as反向剪接位点与IGF2BP2存在结合位点,其侧翼序列与FUS、IGF2BP2、IGF2BP3存在结合位点,CDR1as具有14个开放阅读框及8个内部核糖体进入位点.结论 低表达的CDR1 as可能促进前列腺癌的发生及发展,其主要机制可能是通过吸附miRNA下调具有抑制肿瘤进展的GSTM5等下游靶基因,也可能通过减弱对IGF2BP3等靶蛋白的作用或减少翻译蛋白而发挥功能,其具体机制有待进一步研究.
前列腺癌;circRNA;CDR1as;miRNA;蛋白质
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兰州市科技发展重点支持项目;甘肃省自然科学技术基金;中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院院内课题项目
2021-08-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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