基于网络药理学和分子对接探讨桔梗-甘草防治COVID-19的机制

摘要：

目的 利用网络药理学和分子对接技术探讨桔梗甘草药对干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子机制.方法 基于数据库TCMSP检索桔梗-甘草药对的化学成分和作用靶点,通过Gene Cards、OMIM、TTD、PharmGkb和DrugBank等数据库筛选COVID-19的疾病靶点.应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物成分-靶点的PPI(protein-protein interaction)网络,并寻找核心基因.同时,运用数据库Bioconductor进行GO(gene ontology)分析和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析,预测其作用机制.运用AutoDock tools 1.5.6软件,将主要成分与新型冠状病毒关键结合位点蛋白[SARS-CoV 2主要蛋白酶(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 main protease,Mpro)和血管紧张素转化酶Ⅱ(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)]进行分子对接模拟验证.结果 共挖掘到活性成分99种(桔梗7种和甘草92种)、2766个药物靶点、疾病靶点674个、交集基因靶点67个和核心基因10个,包括RELA、STAT1、MAPK3、TP53、MAPK1、MAPK8、STAT3、MAPK14、IL1B和TNF.GO富集分析显示桔梗-甘草药对干预COVID-19的主要功能是抗氧化反应、细胞对化学压力的反应、凋亡信号通路的调控、对脂多糖的反应和对细菌起源分子的反应等.KEGG通路涉及Coronavirus disease-COVID-19通路、IL-17信号通路等,也与免疫反应相关通路、炎症相关通路、抑制病毒感染通路和其他抑制癌症的通路相关.分子对接结果显示鳞叶甘草素A、槲皮素、甘草查尔酮A和木犀草素与Mpro和ACE2有较好的结合能力.结论 桔梗-甘草药对可以通过多成分、多靶点和多通路联合方式干预新型冠状病毒,同时其核心成分与Mpro、ACE2有较好的结合能力,为COVID-19的防治提供了中医药可能性理论支持.

关键词：桔梗-甘草药对;新型冠状病毒;COVID-19;网络药理学;分子对接

所属期刊栏目：36

分类号：R965(药理学)

资助基金：河北省中医药管理局科研计划项目2021209

在线出版日期：2022-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：927-933