丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族在脑胶质瘤中的免疫相关性及预后价值的生物信息学分析

摘要：

目的 分析丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)基因家族在胶质瘤中的表达、免疫浸润情况及其与预后的相关性.方法 通过利用R语言及多个生物信息学分析数据库,探究SERPIN家族35个基因在癌症基因组图谱(TCGA)胶质瘤肿瘤组织中的变化;选择差异显著的基因,在基因表达谱动态分析(GEPIA)数据库中分析各候选基因高、低表达肿瘤患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)差异,并进一步筛选最具有预后评价价值的基因;通过肿瘤免疫评估资源2.0(TIMER2.0)数据库及肿瘤微环境单细胞转录组学(TISCH)数据库分析基因在泛癌水平表达、在肿瘤组织内细胞集群富集情况及巨噬细胞与胶质瘤内部SERPIN基因表达浸润的相关性,探究SERPIN与肿瘤免疫之间的关系.结果 SERPIN家族中多个基因的表达量均在胶质瘤中有不同程度的改变,且与胶质瘤分级,预后显著相关.其中丝氨酸蛋白酶抑制剂E2(SERPINE2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂H1(SERPINH1)与高级别胶质瘤患者预后存在明显相关性,且二者可能通过对免疫细胞的不同交互途径参与肿瘤免疫微环境内部的免疫调控.结论 SERPIN基因家族的表达同胶质瘤患者的临床预后,肿瘤免疫活动存在密切联系,其中SERPINE2、SERPINH1为效应显著的关键基因.

关键词：丝氨酸蛋白酶抑制剂E2(SERPINE2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂H1(SERPINH1)、胶质瘤、预后分析、免疫浸润

所属期刊栏目：38

分类号：R739.4;Q421;Q954.67+3(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金81971156

在线出版日期：2022-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：122-130