羊口疮病毒重庆株F1L基因克隆与生物信息学分析

摘要：

旨在分析OrfV-CQ株F1L基因的分子特点,预测其编码蛋白的生物学功能.对OrfV-CQ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,利用生物信息学相关软件进行序列分析并对其编码蛋白的二级结构、B细胞表位、T细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽进行预测.结果表明,OrfV-CQ株F1L基因长1 023 bp,编码340个氨基酸,与Shanxi株F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4％和95.0％.Or-fV-CQ株F1L基因编码蛋白的α-螺旋、β-片层、β-转角、无规则卷曲分别为11.21％、10.3％、2.73％、75.76％;可能存在5个B细胞优势抗原表位,3个CTL表位,4个Th细胞表位,无跨膜结构域和信号肽.

关键词：羊口疮病毒、F1L基因、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：26

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：贵州省科学技术基金LH20147667;贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队[2015 4016].Science and Technology Department of Guizhou PrivinceLH20147667;Science and Technology Innovation Talents Team of Animal Disease Prevention and Control and Veterinary Public Health Security of Guizhou Privince20154016

在线出版日期：2017-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1281-1288