猪流行性腹泻病毒陕西渭南株的遗传变异

摘要：

从陕西省渭南某规模化猪场采集疑似猪流行性腹泻(PED)仔猪病料进行病毒检测,旨在从基因遗传变异方面分析疾病发生的可能原因.通过RT-PCR从疑似仔猪20份小肠样品中检测到9份PED病毒阳性样品,并扩增出PED病毒M、ORF3和S基因的部分序列.序列分析结果表明,与CV777疫苗株对比,样品渭南(WN)株PEDV M基因高度保守,同源性为98.2％;ORF3基因存在11处碱基突变,同源性为98.2％;S基因突变较大,存在4个插入区域,分别是164～166、177～179、181～186和416～418 nt,内分核心中和表位区(COE,499～638位氨基酸)存在9个氨基酸突变位点.遗传分析显示,WN株M基因与中国近期分离毒株亲缘关系较近;ORF3基因与同处在G1群中的中国毒株亲缘关系较近,而与CV777疫苗株亲缘关系较远;S基因与中国早期分离毒株及CV777疫苗株亲缘性较远,与当前的流行株亲缘关系密切.这些结果表明,WN株与CV777疫苗株相比,有明显的遗传变异倾向,可能导致目前PEDV疫苗免疫效果下降,PED疫情大规模流行.

关键词：猪流行性腹泻病毒、基因克隆、序列分析、遗传变异

所属期刊栏目：26

分类号：S852.65+9.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省重点农业科技推广及示范项目ZDKJ2014-33;陕西省科技统筹创新工程计划2014KTCQ02-02.Agriculture Science and Technology Promotion and Demonstration Project in Shannxi ProvinceZDKJ2014-33;Shannxi Science and Technology Innovation Project Plan2014KTCQ02-02

在线出版日期：2017-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1273-1280