基于GEO数据库的生物信息学分析筛选食管腺癌发生发展关键基因及通路

摘要：

目的 通过生物信息学方法对GEO芯片数据进行分析,寻找食管腺癌发生发展的关键基因及信号通路.方法 GEO数据库中下载食管腺癌基因表达谱芯片数据,使用R软件进行差异基因的统计学分析,并对这些基因进行生物学过程、信号通路及蛋白互作网络分析.结果 在GEO中获得GSE26886芯片数据,1383个差异基因与食管腺癌发生发展相关,其中表达上调607个,表达下调776个.选择表达改变明显的前200个基因进行进一步分析,这些差异基因参与的生物学过程有代谢、刺激反应、细胞黏附、细胞再生及免疫过程,主要涉及8条信号通路.结论 利用生物信息学方法能有效分析基因芯片数据;食管腺癌的发生与发展是多基因共同参与的结果.这为发掘食管癌早期诊断标志物与治疗相关靶标提供新思路.

关键词：食管腺癌、胃食管反流、GEO数据库、生物信息学

所属期刊栏目：42

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：陕西省肿瘤疾病临床医学研究中心项目No.2019LCZX-02

在线出版日期：2021-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：419-426