"鸟枪"蛋白组学技术鉴定牙龈卟啉单胞菌47A-1亚型外膜蛋白

摘要：

目的 利用shotgun(鸟枪)蛋白质组学策略鉴定牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis, P.g)亚型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白质组学研究,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定基础.方法 提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE电泳分离蛋白,胶内酶解为多肽混合物,应用毛细管高效液相色谱加串联质谱分析,SEQUEST程序进行数据库搜索并鉴定蛋白.结果 用考马斯亮蓝法染色凝胶分离的蛋白,发现P.g47A-1蛋白条带主要在14.3～97ku之间.酶解的肽段经毛细管高效液相色谱分离,得到肽段水平的总离子流图,分析肽段序列后发现P.g47A-1蛋白有623个唯一肽段,鉴定出136种蛋白,包括了51种已知蛋白,85种未知蛋白.结论 Shotgun技术可分析出P.g47A-1大量未知蛋白,尤其是丰度低、疏水性强的外膜蛋白,优于二维凝胶电泳(two dimensional gel electrophoresis, 2-DE)等传统蛋白质组学方法,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定了基础.

关键词：牙龈卟啉单胞菌、外膜蛋白、鸟枪法、蛋白质组学

所属期刊栏目：32

分类号：R34;R37(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30500560

在线出版日期：2011-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：170-174