全基因组测序技术在耐药结核病诊断中的应用价值

摘要：

目的:评估全基因组测序(WGS)技术在耐药结核病诊断中的应用价值.方法:收集2021年1月至2022年9月温州市中心医院收治的65例结核病患者的菌株,采用MGIT960液体法药敏试验及WGS同时对菌株进行链霉素、利福平、异烟肼、乙胺丁醇4种一线抗结核药物的耐药性检测.以MGIT960试验结果为参考标准评价WGS在耐药结核病中的诊断效能.结果:WGS检测后发现链霉素耐药基因突变类型以rpsL_K43R(62.07％,18/29)、rpsL_K43R+rrs_A1401G(13.79％,4/29)为主;利福平耐药基因突变类型以rpoB_S450L(48.15％,26/54)、rpoB_D435V(9.26％,5/54)为主;异烟肼耐药基因突变类型以 katG_S315T(73.72％,37/47)、fabG1_C-15T(8.51％,4/47)为主;乙胺丁醇耐药基因突变类型以embB_M306V(52.38％,11/21)、embB_M306I(14.29％,3/21)为主.以MGIT960试验结果为参考标准,WGS检测链霉素、利福平、异烟肼、乙胺丁醇耐药的灵敏度分别为93.10％、98.11％、95.92％、81.25％,特异度分别为94.44％、83.33％、100.00％、83.67％,kappa值分别为0.875、0.842、0.920、0.578.WGS诊断耐多药结核病(MDR-TB)的灵敏度为93.10％,特异度为100.00％,kappa值为0.887.结论:WGS诊断链霉素、利福平、异烟肼的耐药性具有较高的灵敏度和特异度,一致性较好,诊断MDR-TB效能较好,可为临床早期诊断耐药结核病提供帮助.

关键词：结核分枝杆菌、耐药性、全基因组测序、应用价值

所属期刊栏目：54

分类号：R52(结核病)

资助基金：温州市基础性科研项目Y20210722

在线出版日期：2024-01-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：42-46,52