青霉菌侵染前后哈密瓜转录组的构建及分析

摘要：

丰富的营养物质容易被青霉菌侵染,从而导致哈密瓜的腐坏变质.利用Illumina测序技术考察青霉病原菌侵染前后哈密瓜基因转录组水平的差异变化.利用Illumina平台测序并分析了哈密瓜的转录组信息.过滤后的Clean Reads包含4 947 555 420 nt的碱基数,对Clean Reads进行组装,获得了50 502条Unigene.在NR数据库中,以E value值10-5为截点进行BLAST比对,共有71.28％的Unigenes比对到该数据库中.但还有10 526条Unigene没有比对到NR、NT和Swiss-Prot数据库,可能是哈密瓜果实区别于其它物种而特有的基因,这需要进一步验证.将本次转录组测序得到的39 976个Unigene比对到KEGG数据库进行Pathway注释,共映射到不同的代谢通路128个.

关键词：哈密瓜、转录组、测序、组装结果分析

所属期刊栏目：35

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目31360412

在线出版日期：2016-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：806-814