流感病毒组成蛋白质序列的分析与预测

摘要：

在NCBI数据库中获得1902-2013年关于流感病毒10种组成蛋白的所有氨基酸序列,在MATLAB中采用大数据编程分析,结合详细的HP模型,并基于CGR-WALK模型的方法将全部流感病毒蛋白质序列转化为数据形式,引入时间序列ARFIMA(p,d,q)模型来拟合所有序列,分析10种组成蛋白的序列在近80年的变化趋势,并对其未来10年的发展趋势进行预测.通过分析可以发现,其对流感病毒变异趋势的预测有很好的效果,这为基于大数据分析流感病毒蛋白质序列,预测流感病毒的爆发提供一定的的研究参考价值.

关键词：流感病毒、蛋白质序列、详细HP模型、CGR-WALK模型、ARFIMA(p、d、q)模型

所属期刊栏目：35

分类号：Q51(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金项目11271163;中央高校基本科研业务费专项资金项目JUSRP21117

在线出版日期：2016-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：393-398