用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质

摘要：

以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分类和预测.训练集和测试集相同时和不相同时的预测准确率分别可达66%和64%.

关键词：顺式肽键、氨基酸百分含量、蛋白质二级结构、统计关联

所属期刊栏目：22

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家重点实验室基金

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：7-11