单分子实时测序技术在环境微生物研究中的应用

摘要：

1975年,第一个cDNA的基因组——噬菌体ΦX174基因组的测序完成,标志着测序时代的开始.1996年以来人类基因组计划的发起极大地推动了测序技术的应用和发展,第二代测序技术也被称为高通量测序技术.而单分子DNA测序技术是最近10年内发展起来的新一代的测序技术,称为第三代测序技术,其中包括单分子实时测序(Single molecule real time sequencing,SMRT)、真正单分子测序和单分子纳米孔测序等技术.SMRT测序技术有超长读长、测序周期短、不需要模板扩增和直接检测表观修饰位点等特点,为研究人员提供了新的选择.本文综述了SMRT测序技术的基本原理、性能以及它在微生物16S rRNA基因、微生物全基因组以及微生物宏基因组测序等方面的应用,并分析了SMRT测序技术在环境微生物应用中的优势以及存在的问题.

关键词：Sanger测序法、SMRT测序技术、基因组学、环境微生物

所属期刊栏目：46

分类号：R65;R32

资助基金：江苏高校优势学科建设资助;江苏省研究生科研创新计划KYCX18_2569;江苏省研究生科研与实践创新计划SJCX19_0989,SJCX19_0990

在线出版日期：2019-12-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：3140-3147