环境胁迫和非胁迫条件下类植物乳杆菌转录组分析

摘要：

[背景]类植物乳杆菌L-ZS9是一株在食品发酵与保鲜方面具有潜在应用价值的产细菌素益生菌.[目的]深入了解环境胁迫影响类植物乳杆菌L-ZS9细菌素合成的重要相关调节基因的信息.[方法]通过高通量测序技术对类植物乳杆菌转录组进行测序,对所有转录本进行COG (Clusters of Orthologous Groups)、GO (Gene Ontology)和KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分类和Pathway注释.[结果]转录组测序显示2个样品基因覆盖度都在90％以上,差异表达基因927个,其中744个上调,183个下调.KEGG分析结果表明,649个差异表达基因中68个集中在“ABC转运途径”,占10.48％,其中3个基因表达上调超过16倍,1个基因表达下调超过1/16,暗示类植物乳杆菌L-ZS9细菌素合成与“ABC转运途径”密切相关.另外多个孤儿基因表达变化也超过16倍,有的甚至表达上调达万倍.[结论]进一步拓展了类植物乳杆菌的基因信息,为类植物乳杆菌细菌素代谢途径和逆境反应研究提供了坚实的基础.

关键词：乳杆菌、转录组、基因表达、环境胁迫、细菌素

所属期刊栏目：45

资助基金：National Natural Science Foundation of China 31471707国家自然科学基金31471707

在线出版日期：2018-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：405-412