红豆杉免培养内生细菌多样性的初步研究

摘要：

[目的]了解红豆杉(Taxus chinensis)内生细菌的组成及多样性.[方法]提取红豆杉组织总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rDNA特异性扩增,构建红豆杉内生细菌16S rDNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树.[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的158个阳性克隆归为26个不同的可操作分类单元(OUTs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria,包含Alpha、Beta、Gamma、Delta亚群)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门.其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的58.86％)为最优势类群.序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性.此外,还有一个OUTs在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类.[结论]红豆杉内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元.

关键词：免培养、红豆杉、内生细菌、多样性

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资助基金：陕西省重点实验室项目08JZ21;陕西省教育厅项目08JK248,08JK244

在线出版日期：2013-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：766-774