乙酰胆碱酯酶AChE与1,7-二氮杂咔唑抑制剂的作用机理的分子动力学模拟

摘要：

通过分子对接、分子动力学(MD)模拟以及成键自由能分析方法,从原子水平上模拟研究了3种1,7-二氮杂咔唑衍生物(分别记为M1、M2和M3)与AChE的结合模式及相互作用机理,分析和讨论了研究体系的静电相互作用和范德华相互作用(vdW).用MM-PBSA方法计算的3种抑制剂与AChE之间的结合自由能与抑制剂的实验生物活性数据(IC50值)相对应.分析结果表明,残基S286与抑制剂之间形成的氢键作用有利于抑制剂与AChE之间的结合.范德华相互作用,尤其是抑制剂与关键残基W279和Y334的作用,对抑制剂与AChE之间的结合自由能有较大的贡献,在区分抑制剂M1(或M2)和M3的生物活性上发挥着重要的作用.

关键词：阿尔茨海默症、乙酰胆碱酯酶、1、7-二氮杂咔唑类抑制剂、分子动力学模拟、MM-PBSA

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分类号：O643.1(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金21276122;国家自然科学基金重大研究计划培育项目91434109

在线出版日期：2017-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2065-2074