基于网络药理学、分子对接、分子动力学模拟探讨茸菖胶囊治疗小儿癫痫的靶点机制

摘要：

[目的]笔者团队前期研究已证实茸菖胶囊治疗小儿癫痫(epilepsy)与雌激素水平、自噬过程、AMPK、mTOR信号通路有关,但暂无成份与靶点间的关系,研究将通过网络药理学、分子对接、分子动力学模拟的方法探讨茸菖胶囊多分子、多靶点、多通路的作用机制,为其基础及临床研究提供参考.[方法]通过TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM及文献检索筛选出茸菖胶囊的生物活性成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索疾病靶点信息并取药物、疾病的交集靶点;使用String数据库获得蛋白相互作用关系,并利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点图以及药物-靶点-KEGG网络关系图;利用AutoDockTools、Vina软件进行分子对接;利用Gromacs软件对ESR1与柚皮素进行分子动力学模拟.[结果]茸菖胶囊中共筛选出117个活性成份,115个药物疾病交集靶点,通过CytoNCA插件筛选出18个核心靶点;GO分析表明,主要涉及类固醇代谢过程、对金属离子的反应等;KEGG分析表明,主要涉及脂质和动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路等;分子对接结果显示30对组合Affinity值均≤-5kcal/mol;分子动力学模拟中RMSD及ROG数值波动较小,RMSF中Res307-350,Res525-551数值较大.[结论]通过网络药理学预测了茸菖胶囊治疗癫痫的潜在作用机制,主要通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等分子涉及AKT1、TNF、IL-6等靶点,作用于脂质和动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路、白介素-17信号通路等干预癫痫,这些通路与神经炎症及氧化应激关系最为密切,且预测了前期研究通路中的药物-靶点关系;分子对接结果表明,排名前5的分子与排名前6的靶点结合较紧密;分子动力学模拟结果表明ESR1与柚皮素结合稳定且紧密,提示调节雌激素水平可能是茸菖胶囊治疗癫痫的潜在作用机制之一.

关键词：癫痫、茸菖胶囊、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟

所属期刊栏目：40

分类号：R742.1(神经病学与精神病学)

资助基金：国家自然科学基金;全国中医临床优秀人才研修项目

在线出版日期：2023-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：495-505