粉防己碱三维构象的分子动力学模拟

摘要：

[目的]寻找粉防己碱合理的立体构象.[方法]以单分子为体系,采用CVFF力场和NVT系统,在500K下温度以0.5 fs时间步长模拟了粉防己碱50 ps的运动轨迹.[结果]分子内形成了相对稳定的三角形的环状结构,4个甲氧基在分子的外侧,活动相对比较自由.C42和O38代表的一侧分子环运动范围较大,而C44和O43代表的另侧运动范围相对较小.四氢异喹啉环本身可以翻转成类似船式或椅式的构象,N9所在的环构象变化较大,而N18所在的环变化较小.[结论]以势能为指标,找到了与最低能量相差5 kcal/mol以内的8个构象,为进一步开展粉防己碱作用的理论研究打下了基础.

关键词：粉防己碱、构象、分子动力学模拟

所属期刊栏目：20

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：国家自然科学基金20133020

在线出版日期：2004-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：67-73