10.19640/j.cnki.jtau.2019.02.012
半滑舌鳎黏蛋白MUC5AC基因的克隆与结构预测
黏蛋白作为鱼类黏液的主要成分,在抵御病原感染过程中发挥重要作用.以半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)黏蛋白为研究对象,采用RT-PCR方法对其皮肤黏蛋白MUC5AC(即CsMUC5AC)进行基因克隆及结构预测分析.结果 获得GsMUC5AC基因片段的长度为2 771 bp,推测编码917个氨基酸,预测所含5个抗原表位分布在314-321、507-516、578-589、748-762和811-826aa,3个结构域主要为C8(164-238,624-698 aa)、VWD(1-128,430-588 aa)和VWC(303-365,768-836 aa).二级结构预测C8区主要由α-螺旋构成、VWD区以β折叠为主,三级结构蛋白亚基主要由VWD-C8-VWC组成.构建系统发育树分析显示,其与大菱鲆、攀鲈、罗非鱼黏蛋白MUC5AC亲缘关系较近,与分泌型黏蛋白家族自然聚为一支.以上结果为研究半滑舌鳎黏蛋白MUC5AC基因功能提供科学参考.
半滑舌鳎、黏蛋白、基因克隆、结构预测
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S917.4(水产基础科学)
天津市自然科学基金重点项目18JCYBJC29900,16JCZDJC33500;天津市水产生态及养殖重点实验室开放基金项目TJAE201803;天津市水产产业技术体系创新团队ITTFRS2017009;天津农学院综投平台项目J01009030638
2019-09-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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