rno-miR-16-5p靶基因预测、生物信息学分析及鉴定

摘要：

目的 对rno-miR-16-5p靶基因进行预测、生物信息学分析及鉴定,为深入研究rno-miR-16-5p的生物学功能奠定基础.方法 应用TargetScan、miRDB、miRanda数据库预测出rno-miR-16-5p的靶基因,对靶基因进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析,并利用双荧光素酶报告实验鉴定.结果 3个数据库预测出的交集靶基因有48个,rno-miR-16-5p靶基因主要富集于细胞生长发育、促进突触合成及神经系统发育等生物过程,富集于血小板α颗粒、细胞质动力蛋白复合体等细胞组件与粘多糖分子功能中.信号通路则显著富集于唾液分泌通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路与胰腺分泌通路.双荧光素酶报告实验结果提示脑源性神经营养因子(BDNF)是rno-miR-16-5p的靶基因.结论 rno-miR-16-5p靶向作用于BDNF的表达,可能通过参与cAMP信号通路促进神经系统发育的生物学过程.

关键词：rno-miR-16-5p、靶基因、生物信息学、脑源性神经营养因子、信号通路

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资助基金：广东省自然科学基金-博士科研启动项目2015A030310067;三峡大学开放基金项目KJ2018QT006

在线出版日期：2019-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2215-2219